Zašto su to glava, prsa i želudac, a ne prsa, glava i želudac: Koji je redoslijed atomskih veza otkriven NMR-om?

U ovom blog postu, objasnit ću jednostavnim riječima kako NMR pomaže u određivanju redoslijeda i načina na koji su atomi vezani unutar spoja.

 

Zašto trebamo znati redoslijed atomskih veza?

Baš kao u dječjem vicu: „Što dobiješ ako mrava podijeliš na tri dijela?“ – koji nas nasmijava – pitanja o sastavu tvari puno su ozbiljnija i važnija u kemiji. Ako bi se pitali koji atomi nastaju kada se molekula vode podijeli na dva dijela, većina ljudi bi odgovorila vodik i kisik. Slično tome, kaže se da se ugljikov dioksid sastoji od ugljika i kisika. Drugim riječima, spojevi su sastavljeni od atoma kao svojih osnovnih jedinica, a bilo je relativno lako odrediti koji su elementi prisutni korištenjem klasičnih analitičkih metoda poput izgaranja.
Međutim, nije dovoljno samo znati koji su elementi prisutni. To je zato što čak i isti atomi mogu pokazivati ​​potpuno različita svojstva ovisno o redoslijedu ili načinu vezanja. Na primjer, aceton i propanol, koji imaju istu molekularnu formulu (C₃H₈O), koriste se u različite svrhe. Stoga je u kemiji postalo važno ići dalje od pukog pitanja „od čega je to napravljeno?“ do razjašnjenja „kako su atomi povezani?“ - i metode za razjašnjavanje ovog redoslijeda i strukture vezanja postale su nužne.
Vraćajući se na primjer vode, teško je golim okom ili jednostavnom manipulacijom odrediti je li voda HOH ili HHO (iako je, naravno, zapravo HOH). Tehnike za određivanje redoslijeda veza i prisutnosti susjednih atoma temeljne su i bitne za razumijevanje svojstava i funkcija molekula. Jedna od široko korištenih analitičkih metoda za rješavanje takvih problema je NMR.

 

Principi, primjene i ograničenja NMR-a

NMR je kratica za „nuklearnu magnetsku rezonancu“. Iako naziv može zvučati komplicirano, koncept je jednostavan. Kada se vanjsko magnetsko polje primijeni na „spin“ – intrinzično svojstvo atomskih jezgri – jezgre se poravnavaju u određenom smjeru; ako se zatim primijeni energija, određene jezgre apsorbiraju tu energiju i mijenjaju svoje stanje. Energija apsorbirana u toj točki neznatno varira ovisno o vrsti jezgre i njezinoj okolini unutar molekule – odnosno o prisutnosti i položaju okolnih atoma. NMR mjeri te suptilne energetske razlike kako bi odredio raspored atoma i identificirao koji su atomi u blizini.
Da bismo to detaljnije objasnili, atomske jezgre teže poravnati svoje spinove u smjeru suprotnom od vanjskog magnetskog polja, a to poravnanje u konačnici generira magnetsko polje. Inducirano magnetsko polje koje generiraju jezgre djeluje u smjeru koji slabi vanjsko magnetsko polje; ovaj princip sličan je tendenciji gumene trake da se skuplja kada se rasteže. Kada se specifične energetske razine sekvencijalno primjenjuju na jezgre u njihovom stanju poravnanja induciranom vanjskim magnetskim poljem, svaka atomska jezgra apsorbira energiju koja odgovara njezinoj vlastitoj frekvenciji, uzrokujući rezonancu, a iz tih rezultata dobivaju se strukturne informacije o unutrašnjosti molekule.
Iako se NMR klasificira u različite vrste ovisno o ciljanom nuklidu, metode koje se najčešće koriste za razjašnjavanje veznih struktura su H-NMR (spektroskopija vodikove jezgre) i 13C-NMR (spektroskopija izotopa ugljika 13C). H-NMR otkriva položaje atoma vodika unutar molekule i na koje su atome vezani. 13C-NMR se koristi za određivanje okruženja atoma ugljika.
To bi moglo postaviti pitanje: zašto se atomi poput kisika ne mogu koristiti u NMR analizi? Razlog je taj što ne posjeduju sve atomske jezgre „spin“ potreban za NMR. Nuklidi s parnim atomskim brojevima i parnim masenim brojevima često imaju nuklearni spin od 0; nemaju magnetska svojstva i stoga ne proizvode NMR signal. Na primjer, budući da se uobičajeni ugljik-12 ne može izravno promatrati, umjesto njega se koristi izotop ugljik-13, koji postoji u malim količinama u prirodi. Suprotno tome, vodik ima nuklearni spin i obilno je prisutan, što H-NMR čini najčešće korištenom tehnikom.
Opseg primjene NMR-a je vrlo širok. Strukturne informacije mogu se dobiti putem NMR-a za sve, od malih organskih molekula do polimera i velikih biomolekula poput proteina. Budući da su primarni elementi koji čine biomolekule ograničeni na vodik, ugljik, kisik i dušik, određivanje veznih odnosa između tih atoma pomoću NMR-a izuzetno je korisno u razjašnjavanju trodimenzionalne strukture i funkcije proteina.
Nadalje, princip NMR-a je također u središtu MRI-a (magnetske rezonancije), medicinske tehnologije snimanja. MRI, koji se koristi u bolnicama, primjenjuje NMR princip na atome vodika u ljudskom tijelu (prvenstveno vodik iz vode i masti) za vizualizaciju struktura tkiva. Za razliku od rendgenskih zraka, ne koristi jako zračenje, što ga čini bezopasnim za ljudsko tijelo, a budući da većina ljudskog tijela sadrži vodik, mogu se dobiti detaljne slike.
Naravno, NMR ima svoja ograničenja. Kao što je ranije spomenuto, nisu svi atomi prikladni za NMR promatranje, a neke elemente je teško izravno promatrati. Međutim, kada se NMR koristi zajedno s drugim analitičkim metodama, poput masene spektrometrije (MS) i infracrvene spektroskopije (IR), može pružiti komplementarne informacije o atomima osim vodika i ugljika. Kombiniranjem ovih tehnika, u modernoj kemiji izuzetno je rijetko susresti se sa slučajem kada se molekularna struktura ne može odrediti.
Zaključno, NMR je jedan od najosnovnijih i najmoćnijih alata za razjašnjavanje nepoznatih spojeva. Od povijesnog postignuća analize molekula u šalici vode kako bi se utvrdilo kako su vodik i kisik vezani unutar nje, do današnjeg određivanja strukture proteina i medicinskog snimanja, NMR je poslužio kao prozor u molekularni svijet. Kako analitičke tehnike nastavljaju napredovati, s vremenom bi nam mogle biti potrebne tako sofisticirane informacije da bi odgovor na jednostavno pitanje poput "Što se događa kada razdvojite vodu?" mogao zahtijevati objašnjenje koje se proteže na nekoliko stranica A4 papira. Čak i tada će NMR ostati ključna osnova.

 

O autoru